В Готэм-Сити наступает эпоха перемен, но не к лучшему. Город захлестнула волна изощренных преступлений, которые несут на себе печать древнего японского искусства ниндзюцу. За этим стоит таинственная и могущественная Лига якудза, чьи корни уходят в феодальную Японию. Их лидер, безжалостный Орочи, стремится не просто к власти, а к полной трансформации Готэма по своим жестоким законам чести и господства. Брюс Уэйн, расследуя серию загадочных нападений, обнаруживает, что столкнулся не с обычными бандитами, а с высококлассными воинами-теневиками, чьи методы оказываются странно знакомыми. Его путь приводит к шокирующему открытию: истоки его собственной боевой философии и костюма Тёмного Рыцаря тесно переплетены с кланом ниндзя, от которого произошла и сама Лига якудза. Теперь Бэтмену предстоит сразиться не только с внешним врагом, но и с призраками своего прошлого.
Противостояние перерастает в масштабную войну за душу города. Используя древние свитки и высокие технологии, Орочи начинает реализацию своего главного плана, превращая целые районы Готэма в опорные пункты, управляемые самурайской дисциплиной и страхом. Бэтмен, будучи мастером адаптации, вынужден эволюционировать, объединив свои фирменные гаджеты с тактикой и оружием ниндзя, чтобы бить врага его же методами. Ему придется пройти через лабиринт предательств, где границы между союзником и противником стираются, и столкнуться с воинами Лиги, каждый из которых является живым оружием. Финал этой войны решится не только в эпичных сражениях на фоне неоновых крыш и древних японских символов, но и в битве идеологий, где Бэтмен должен доказать, что его путь справедливости сильнее тысячелетних традиций безжалостного насилия.
