Третий сезон «Юань Лун» начинается с того, что Юань Лун и его команда, наконец, возвращаются в мир людей после долгого и изнурительного путешествия по демоническим землям. Однако радость от возвращения быстро омрачается: они застают родной город в руинах, а жители — в панике. Оказывается, за время их отсутствия граница между мирами истончилась настолько, что могущественные демоны низшего ранга начали свободно проникать в реальность. Но главная угроза кроется не в них. Таинственная организация «Печать Пустоты», состоящая из бывших стражей и отступников, использует хаос для проведения ритуала по призыву Изначального Хаоса — сущности, способной переписать законы мироздания. Юань Лун вынужден столкнуться с тем, что его собственная сила, дарованная драконьим глазом, начинает вести себя непредсказуемо, словно реагируя на приближение древнего зла. В попытке найти союзников герои отправляются к забытому клану алхимиков, которые когда-то запечатали Хаос, но те встречают их враждебно, обвиняя в нарушении древнего баланса.
Параллельно раскрывается тайна прошлого Юань Луна: его отец, считавшийся погибшим, на самом деле был одним из создателей «Печати Пустоты» и добровольно ушел в изгнание, чтобы сдерживать Хаос изнутри. Теперь, когда печать разрушается, отец передает сыну последнее послание через артефакт, указывая на единственный способ остановить катастрофу — объединить четыре стихийных ключа, разбросанных по разным измерениям. Команда разделяется: одни отправляются в огненное царство вулканов, другие — в ледяные пустоши, где обитают духи-хранители. В процессе Юань Лун сталкивается с предательством близкого друга, который поддается искушению власти, предложенной организацией. Кульминация наступает, когда герои собирают ключи, но выясняется, что Изначальный Хаос уже принял форму и вселился в тело одного из них. Финальная битва происходит не только с монстром, но и с внутренними демонами: Юань Луну приходится пожертвовать частью своей драконьей сущности, чтобы выжечь скверну, не убивая друга. Сезон заканчивается на тревожной ноте — мир спасен, но драконий глаз героя полностью гаснет, а в небе появляется трещина, намекающая на то, что Хаос лишь отступил, но не уничтожен.